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Einträge mit Organisationseinheit "07 Fachbereich Chemie > Clemens-Schöpf-Institut > Fachgebiet Biochemie > Biologische Chemie"

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Artikel

Lill, Annika ; Schweipert, Markus ; Nehls, Thomas ; Wurster, Eva ; Lermyte, Frederik ; Meyer‐Almes, Franz‐Josef ; Schmitz, Katja (2024)
Design and synthesis of peptides as stabilizers of histone deacetylase 4.
In: Journal of Peptide Science
doi: 10.1002/psc.3603
Artikel, Bibliographie

Lill, Annika ; Herbst, Alexandra ; Langhans, Markus ; Paech, Steffen ; Hamacher, Kay ; Biesalski, Markus ; Meckel, Tobias ; Schmitz, Katja (2024)
Investigating cellulose binding of peptides derived from carbohydrate binding module 1.
In: Biomacromolecules, 25 (9)
doi: 10.1021/acs.biomac.4c00575
Artikel, Bibliographie

Wack, Julia S. ; Brahm, Kevin ; Babel, Philipp ; Dalton, James A. R. ; Schmitz, Katja (2023)
Effect of macrocyclization and tetramethylrhodamine labeling on chemokine binding peptides.
In: Journal of Peptide Science, 29 (7)
doi: 10.1002/psc.3486
Artikel, Bibliographie

Kilb, Michelle Fiona ; Moos, Yannik ; Eckes, Stefanie ; Braun, Joy ; Ritz, Ulrike ; Nickel, Daniela ; Schmitz, Katja (2021)
An Additively Manufactured Sample Holder to Measure the Controlled Release of Vancomycin from Collagen Laminates.
In: Biomedicines, 9 (11)
doi: 10.3390/biomedicines9111668
Artikel, Bibliographie

Braun, Joy ; Eckes, Stefanie ; Kilb, Michelle Fiona ; Fischer, Dirk ; Eßbach, Claudia ; Rommens, Pol Maria ; Drees, Philipp ; Schmitz, Katja ; Nickel, Daniela ; Ritz, Ulrike (2021)
Mechanical characterization of rose bengal and green light crosslinked collagen scaffolds for regenerative medicine.
In: Regenerative Biomaterials, 8 (6)
doi: 10.1093/rb/rbab059
Artikel, Bibliographie

Engemann, Victoria I. ; Rink, Ina ; Kilb, Michelle F. ; Hungsberg, Maximilian ; Helmer, Dorothea ; Schmitz, Katja (2021)
Cell-based actin polymerization assay to analyze chemokine inhibitors.
In: Journal of Pharmacological and Toxicological Methods, 109
doi: 10.1016/j.vascn.2021.107056
Artikel, Bibliographie

Kilb, Michelle F. ; Engemann, Victoria I. ; Siddique, Asma ; Stark, Robert W. ; Schmitz, Katja (2021)
Immobilisation of CXCL8 gradients in microfluidic devices for migration experiments.
In: Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 198
doi: 10.1016/j.colsurfb.2020.111498
Artikel, Bibliographie

Eckes, Stefanie ; Braun, Joy ; Wack, Julia S. ; Ritz, Ulrike ; Nickel, Daniela ; Schmitz, Katja (2020)
Rose Bengal Crosslinking to Stabilize Collagen Sheets and Generate Modulated Collagen Laminates.
In: International Journal of Molecular Sciences, 21 (19)
doi: 10.3390/ijms21197408
Artikel, Bibliographie

Braun, Joy ; Eckes, Stefanie ; Rommens, Pol Maria ; Schmitz, Katja ; Nickel, Daniela ; Ritz, Ulrike (2020)
Toxic Effect of Vancomycin on Viability and Functionality of Different Cells Involved in Tissue Regeneration.
In: Antibiotics, 9 (5)
doi: 10.3390/antibiotics9050238
Artikel, Bibliographie

Wiegand, Pascal ; Lupu, Loredana ; Hüttmann, Nico ; Wack, Julia ; Rawer, Stephan ; Przybylski, Michael ; Schmitz, Katja (2020)
Epitope Identification and Affinity Determination of an Inhibiting Human Antibody to Interleukin IL8 (CXCL8) by SPR- Biosensor–Mass Spectrometry Combination.
In: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 31 (1)
doi: 10.1021/JASMS.9B00050
Artikel, Bibliographie

Bensinger, Dennis ; Stubba, Daniel ; Cremer, Anjali ; Kohl, Vanessa ; Waßmer, Theresa ; Stuckert, Johanna ; Engemann, Victoria ; Stegmaier, Kimberly ; Schmitz, Katja ; Schmidt, Boris (2019)
Virtual Screening Identifies Irreversible FMS-like Tyrosine Kinase 3 Inhibitors with Activity toward Resistance-Conferring Mutations.
In: Journal of Medicinal Chemistry, 62 (5)
doi: 10.1021/acs.jmedchem.8b01714
Artikel, Bibliographie

Stubba, Daniel ; Bensinger, Dennis ; Steinbacher, Janika ; Proskurjakov, Lilia ; Salcedo Gómez, Álvaro ; Schmidt, Uwe ; Roth, Stefan ; Schmitz, Katja ; Schmidt, Boris (2019)
Cell‐Based Optimization of Covalent Reversible Ketoamide Inhibitors Bridging the Unprimed to the Primed Site of the Proteasome β5 Subunit.
In: ChemMedChem, 14 (23)
doi: 10.1002/cmdc.201900472
Artikel, Bibliographie

Brahm, Kevin ; Wack, Julia S. ; Eckes, Stefanie ; Engemann, Victoria ; Schmitz, Katja (2019)
Macrocyclization enhances affinity of chemokine‐binding peptoids.
In: Biopolymers, 110 (4)
doi: 10.1002/bip.23244
Artikel, Bibliographie

Brahm, Kevin ; Wack, Julia S. ; Eckes, Stefanie ; Engemann, Viktoria ; Schmitz, Katja (2018)
Makrocyclisierung erhöht die Affinität von Chemokin-bindenden Peptoiden.
In: Biopolymers
doi: 10.1002/bip.23244
Artikel, Bibliographie

Helmer, Dorothea ; Rink, Ina ; Dalton, James A. R. ; Brahm, Kevin ; Jöst, Marina ; Nargang, Tobias M. ; Blum, Witali ; Wadhwani, Parvesh ; Brenner-Weiss, Gerald ; Rapp, Bastian E. ; Giraldo, Jesús ; Schmitz, Katja (2018)
Correction: Rational design of a peptide capture agent for CXCL8 based on a model of the CXCL8:CXCR1 complex.
In: RSC Advances, 8 (30)
doi: 10.1039/C8RA90035C
Artikel, Bibliographie

Groß, Christine ; Hamacher, Kay ; Schmitz, Katja ; Jager, Sven (2017)
Cleavage Product Accumulation Decreases the Activity of Cutinase during PET Hydrolysis.
In: Journal of chemical information and modeling, 57 (2)
Artikel, Bibliographie

Helmer, D. ; Rink, I. ; Dalton, J. ; Brahm, K. ; Wack, J. ; Wadhwani, P. ; Brenner-Weiss, G. ; Rapp, B. E. ; Giraldo, J. ; Schmitz, K. (2016)
Receptor derived peptides and peptide mimetics as chemokine inhibitors.
In: Journal of peptide science : an official publication of the European Peptide Society, 22
Artikel, Bibliographie

Girrbach, Maria ; Rink, Ina ; Ladnorg, Tatjana ; Azucena, Carlos ; Heißler, Stefan ; Haraszti, Tamás ; Schepers, Ute ; Schmitz, Katja (2016)
Leukocyte responses to immobilized patterns of CXCL8.
In: Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 142
doi: 10.1016/j.colsurfb.2016.03.004
Artikel, Bibliographie

Helmer, Dorothea ; Brahm, Kevin ; Helmer, Christian ; Wack, Julia Susanne ; Brenner-Weiss, Gerald ; Schmitz, Katja (2016)
Two-channel image analysis method for the screening of OBOC libraries.
In: Analytical Methods, 8 (20)
doi: 10.1039/C5AY02981C
Artikel, Bibliographie

Buß, O. ; Jager, S. ; Dold, S.-M. ; Zimmermann, S. ; Hamacher, Kay ; Schmitz, K. ; Rudat, J. (2016)
Statistical Evaluation of HTS Assays for Enzymatic Hydrolysis of β-Keto Esters.
In: PloS one, 11 (1)
Artikel, Bibliographie

Weber, Christian ; Adam, Elisabeth ; Pape, Andreas ; Jöst, Marina ; Meybohm, Patrick ; Schmitz, Katja ; Zacharowski, Kai ; Hermann, Martin ; Fries, Dietmar (2015)
Der Gerinnungsfaktor XIII – Pathophysiologie, Klinik und Therapie von Mangelzuständen.
In: AINS - Anästhesiologie · Intensivmedizin · Notfallmedizin · Schmerztherapie, 50 (11/12)
doi: 10.1055/s-0041-105951
Artikel, Bibliographie

Helmer, Dorothea ; Rink, Ina ; Dalton, James A. R. ; Brahm, Kevin ; Jöst, Marina ; Nargang, Tobias M. ; Blum, Witali ; Wadhwani, Parvesh ; Brenner-Weiss, Gerald ; Rapp, Bastian E. ; Giraldo, Jesús ; Schmitz, Katja (2015)
Rational design of a peptide capture agent for CXCL8 based on a model of the CXCL8:CXCR1 complex.
In: RSC Advances, 5 (33)
doi: 10.1039/C4RA13749C
Artikel, Bibliographie

Rink, Ina ; Rink, Jan ; Helmer, Dorothea ; Sachs, Daniel ; Schmitz, Katja (2015)
A Haptotaxis Assay for Leukocytes Based on Surface-Bound Chemokine Gradients.
In: The Journal of Immunology, 194 (11)
doi: 10.4049/jimmunol.1500148
Artikel, Bibliographie

Jehle, Katja ; Cato, Laura ; Neeb, Antje ; Muhle-Goll, Claudia ; Jung, Nicole ; Smith, Emmanuel W. ; Buzon, Victor ; Carbó, Laia R. ; Estébanez-Perpiñá, Eva ; Schmitz, Katja ; Fruk, Ljiljana ; Luy, Burkhard ; Chen, Yu ; Cox, Marc B. ; Bräse, Stefan ; Brown, Myles ; Cato, Andrew C. B. (2014)
Coregulator Control of Androgen Receptor Action by a Novel Nuclear Receptor-binding Motif.
In: Journal of Biological Chemistry, 289 (13)
doi: 10.1074/JBC.M113.534859
Artikel, Bibliographie

Girrbach, Maria ; Meliciani, Irene ; Waterkotte, Björn ; Berthold, Susann ; Oster, Alisha ; Brurein, Fiona ; Strunk, Timo ; Wadhwani, Parvesh ; Berensmeier, Sonja ; Wenzel, Wolfgang ; Schmitz, Katja (2014)
A fluorescence polarization assay for the experimental validation of anin silicomodel of the chemokine CXCL8 binding to receptor-derived peptides.
In: Physical Chemistry Chemical Physics, 16 (17)
doi: 10.1039/C3CP53850H
Artikel, Bibliographie

Waterkotte, Björn ; Bally, Florence ; Nikolov, Pavel M. ; Waldbaur, Ansgar ; Rapp, Bastian E. ; Truckenmüller, Roman ; Lahann, Jörg ; Schmitz, Katja ; Giselbrecht, Stefan (2013)
Biofunctional Micropatterning of Thermoformed 3D Substrates.
In: Advanced Functional Materials, 24 (4)
doi: 10.1002/adfm.201301093
Artikel, Bibliographie

Schmitz, Katja (2013)
Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology. Von David Van Vranken und Gregory A. Weiss.
In: Angewandte Chemie, 125 (24)
doi: 10.1002/ange.201303373
Artikel, Bibliographie

Pizzo, Salvatore V. ; Maddalo, Danilo ; Neeb, Antje ; Jehle, Katja ; Schmitz, Katja ; Muhle-Goll, Claudia ; Shatkina, Liubov ; Walther, Tamara Vanessa ; Bruchmann, Anja ; Gopal, Srinivasa M. ; Wenzel, Wolfgang ; Ulrich, Anne S. ; Cato, Andrew C. B. (2012)
A Peptidic Unconjugated GRP78/BiP Ligand Modulates the Unfolded Protein Response and Induces Prostate Cancer Cell Death.
In: PLoS ONE, 7 (10)
doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0045690
Artikel, Bibliographie

Jochum, Tobias ; Ritz, Manuela E. ; Schuster, Christoph ; Funderburk, Sarah F. ; Jehle, Katja ; Schmitz, Katja ; Brinkmann, Falko ; Hirtz, Michael ; Moss, David ; Cato, Andrew C.B. (2012)
Toxic and non-toxic aggregates from the SBMA and normal forms of androgen receptor have distinct oligomeric structures.
In: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease, 1822 (6)
doi: 10.1016/j.bbadis.2012.02.006
Artikel, Bibliographie

Waldbaur, Ansgar ; Waterkotte, Björn ; Schmitz, Katja ; Rapp, Bastian E. (2012)
Maskless Projection Lithography for the Fast and Flexible Generation of Grayscale Protein Patterns.
In: Small, 8 (10)
doi: 10.1002/smll.201102163
Artikel, Bibliographie

Wiese, Dana ; Schmitz, Katja (2011)
Expression of recombinant human interleukin-8 and its purification using a single buffer system.
In: Journal of Immunological Methods, 364 (1-2)
doi: 10.1016/j.jim.2010.11.004
Artikel, Bibliographie

Borstel, S. von ; Mikut, R. ; Schmitz, K. ; Reischl, M. (2011)
Feature extraction and plausability check of spots in small-molecule microarray images.
In: Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 56 (s1)
doi: 10.1515/BMT.2011.858
Artikel, Bibliographie

Diler, Ebru ; Obst, Ursula ; Schmitz, Katja ; Schwartz, Thomas (2011)
A lysozyme and magnetic bead based method of separating intact bacteria.
In: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 401 (1)
doi: 10.1007/S00216-011-5065-5
Artikel, Bibliographie

Schepers, Ute ; Schmitz, Katja ; Hahn, Frank (2010)
Modified GSMP Synthesis Greatly Improves the Disulfide Crosslink of T7 Run-Off siRNAs with Cell Penetrating Peptides.
In: Synlett, 2010 (19)
doi: 10.1055/S-0030-1259022
Artikel, Bibliographie

Meliciani, Irene ; Klenin, Konstantin ; Strunk, Timo ; Schmitz, Katja ; Wenzel, Wolfgang (2009)
Probing hot spots on protein-protein interfaces with all-atom free-energy simulation.
In: The Journal of Chemical Physics, 131 (3)
doi: 10.1063/1.3177008
Artikel, Bibliographie

Hahn, Frank ; Schmitz, Katja ; Balaban, Teodor S. ; Bräse, Stefan ; Schepers, Ute (2008)
Conjugation of Spermine Facilitates Cellular Uptake and Enhances Antitumor and Antibiotic Properties of Highly Lipophilic Porphyrins.
In: ChemMedChem, 3 (8)
doi: 10.1002/cmdc.200800013
Artikel, Bibliographie

Schmitz, Katja ; Haggarty, Stephen J. ; McPherson, Olivia M. ; Clardy, Jon ; Koehler, Angela N. (2007)
Detecting Binding Interactions Using Microarrays of Natural Product Extracts.
In: Journal of the American Chemical Society, 129 (37)
doi: 10.1021/ja073965s
Artikel, Bibliographie

Schröder, Tina ; Schmitz, Katja ; Niemeier, Nicole ; Balaban, Teodor S. ; Krug, Harald F. ; Schepers, Ute ; Bräse, Stefan (2007)
Solid-Phase Synthesis, Bioconjugation, and Toxicology of Novel Cationic Oligopeptoids for Cellular Drug Delivery.
In: Bioconjugate Chemistry, 18 (2)
doi: 10.1021/bc0602073
Artikel, Bibliographie

Diallo, M. ; Arenz, C. ; Schmitz, K. ; Sandhoff, K. ; Schepers, U. (2004)
Long Endogenous dsRNAs Can Induce Complete Gene Silencing in Mammalian Cells and Primary Cultures.
In: Oligonucleotides, 13 (5)
doi: 10.1089/154545703322617069
Artikel, Bibliographie

Schmitz, Katja ; Schepers, Ute (2004)
Polyamides as Artificial Transcription Factors: Novel Tools for Molecular Medicine?
In: Angewandte Chemie International Edition, 43 (19)
doi: 10.1002/anie.200301745
Artikel, Bibliographie

Diallo, Mustapha ; Arenz, Christoph ; Schmitz, Katja ; Sandhoff, Konrad ; Schepers, Ute (2003)
RNA Interference: Analyzing the Function of Glycoproteins and Glycosylating Proteins in Mammalian Cells.
In: Methods in enzymology, 363
doi: 10.1016/S0076-6879(03)01051-6
Artikel, Bibliographie

Buchkapitel

Helmer, Dorothea ; Schmitz, Katja (2016)
Peptides and Peptide Analogs to Inhibit Protein-Protein Interactions.
In: Protein Targeting Compounds
doi: 10.1007/978-3-319-32805-8_8
Buchkapitel, Bibliographie

Konferenzveröffentlichung

Becker, Holger ; Waldbaur, Ansgar ; Waterkotte, Björn ; Leuthold, Juerg ; Schmitz, Katja ; Rapp, Bastian E. ; Gray, Bonnie L. (2013)
Rapid biochemical functionalization of technical surfaces by means of a photobleaching-based maskless projection lithography process.
Microfluidics, BioMEMS, and Medical Microsystems XI. San Francisco, California (03.02.2013-05.02.2013)
doi: 10.1117/12.2003103
Konferenzveröffentlichung, Bibliographie

Schmitz, K. ; Arenz, C. ; Diallo, M. ; Cryns, A. ; Hoffmann, S. ; Landhoff, K. ; Schepers, U.
Hrsg.: Bereths, J. (2003)
RNA interference: New approaches to study protein function in mammalian cells and organisms.
Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Zellbiologie und der Gesellschaft für Entwicklungsbiologie. Bonn, Deutschland (26.03.2003-29.03.2003)
Konferenzveröffentlichung, Bibliographie

Diallo, M. ; Arenz, C. ; Schmitz, K. ; Sandhoff, K. ; Schepers, U. (2003)
Stable post transcriptional gene silencing og glucosylceramicle-synthase by RNA interference in human cells.
Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Zellbiologie und der Gesellschaft für Entwicklungsbiologie. Bonn, Deutschland (26.03.2003-29.03.2003)
Konferenzveröffentlichung, Bibliographie

Dissertation

Oliviero, Claudia (2023)
Generation of a Host Cell line containing a MAR-rich landing pad for site specific integration and expression of transgenes.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00026392
Dissertation, Erstveröffentlichung, Verlagsversion

Charalampidou, Anna (2023)
Development of stabilized FK506 binding protein 51 variants & generation of ligand-based affinity chromatography beads.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00026351
Dissertation, Erstveröffentlichung, Verlagsversion

Kilb, Michelle Fiona (2023)
Modification of biomaterials for the immobilization and release of chemokines.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00023641
Dissertation, Erstveröffentlichung, Verlagsversion

Engemann, Victoria (2021)
Entwicklung zellbasierter Assays für die Evaluation von Chemokininhibitoren.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00017372
Dissertation, Erstveröffentlichung, Verlagsversion

Brahm, Kevin (2020)
Untersuchung von Peptidomimetika als Inhibitoren für das Chemokin CXCL8.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.25534/tuprints-00011794
Dissertation, Erstveröffentlichung

Sapir, Ashi (2020)
Evaluation of Yeast Display Fab Libraries Derived from Tumor Infiltrating B Cells.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.25534/tuprints-00011371
Dissertation, Erstveröffentlichung

Jöst, Marina (2016)
Etablierung von zellbasierten Assays zur Identifizierung von Inhibitoren des Chemokins CXCL8.
Technische Universität Darmstadt
Dissertation, Erstveröffentlichung

Masterarbeit

Vollmers, Luis (2023)
Prediction of Cytotoxicity Related PubChem Assays Using High-Content-Imaging Descriptors derived from Cell-Painting.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00020236
Masterarbeit, Erstveröffentlichung, Verlagsversion

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