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Site‐Specific Antibody Fragment Conjugates for Reversible Staining in Fluorescence Microscopy

Schwach, Jonathan ; Kolobynina, Ksenia ; Brandstetter, Katharina ; Gerlach, Marcus ; Ochtrop, Philipp ; Helma, Jonas ; Hackenberger, Christian P. R. ; Harz, Hartmann ; Cardoso, M. Cristina ; Leonhardt, Heinrich ; Stengl, Andreas (2024)
Site‐Specific Antibody Fragment Conjugates for Reversible Staining in Fluorescence Microscopy.
In: ChemBioChem, 2020, 22 (7)
doi: 10.26083/tuprints-00017776
Artikel, Zweitveröffentlichung, Verlagsversion

Es ist eine neuere Version dieses Eintrags verfügbar.

URL / URN: https://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/17776

Kurzbeschreibung (Abstract)

Antibody conjugates have taken a great leap forward as tools in basic and applied molecular life sciences that was enabled by the development of chemoselective reactions for the site‐specific modification of proteins. Antibody‐oligonucleotide conjugates combine the antibody's target specificity with the reversible, sequence‐encoded binding properties of oligonucleotides like DNAs or peptide nucleic acids (PNAs), allowing sequential imaging of large numbers of targets in a single specimen. In this report, we use the Tub‐tag® technology in combination with Cu‐catalyzed azide‐alkyne cycloaddition for the site‐specific conjugation of single DNA and PNA strands to an eGFP‐binding nanobody. We show binding of the conjugate to recombinant eGFP and subsequent sequence‐specific annealing of fluorescently labelled imager strands. Furthermore, we reversibly stain eGFP‐tagged proteins in human cells, thus demonstrating the suitability of our conjugation strategy to generate antibody‐oligonucleotides for reversible immunofluorescence imaging.

Typ des Eintrags:

Artikel

Erschienen:

2024

Autor(en):

Schwach, Jonathan ; Kolobynina, Ksenia ; Brandstetter, Katharina ; Gerlach, Marcus ; Ochtrop, Philipp ; Helma, Jonas ; Hackenberger, Christian P. R. ; Harz, Hartmann ; Cardoso, M. Cristina ; Leonhardt, Heinrich ; Stengl, Andreas

Art des Eintrags:

Zweitveröffentlichung

Titel:

Site‐Specific Antibody Fragment Conjugates for Reversible Staining in Fluorescence Microscopy

Sprache:

Englisch

Publikationsjahr:

5 Januar 2024

Ort:

Darmstadt

Publikationsdatum der Erstveröffentlichung:

2020

Ort der Erstveröffentlichung:

Weinheim

Verlag:

Wiley-VCH

Titel der Zeitschrift, Zeitung oder Schriftenreihe:

ChemBioChem

Jahrgang/Volume einer Zeitschrift:

(Heft-)Nummer:

DOI:

10.26083/tuprints-00017776

URL / URN:

https://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/17776

Zugehörige Links:

Verlags-DOI

Herkunft:

Zweitveröffentlichung DeepGreen

Kurzbeschreibung (Abstract):

Alternatives oder übersetztes Abstract:

Alternatives Abstract	Sprache
Protein-oligonucleotide conjugates. We present a novel strategy for the efficient and site-specific generation of nanobody-oligonucleotide conjugates in a 1 : 1 stoichiometry by Tub-tag-mediated conjugation. We show a proof-of-concept that these conjugates can readily be used for reversible staining in confocal fluorescence microscopy.	Englisch

Freie Schlagworte:

antibody conjugates, immunofluorescence staining, nanobodies, peptide nucleic acids, super-resolution microscopy, Tub-tag labelling

Status:

Verlagsversion

URN:

urn:nbn:de:tuda-tuprints-177764

Zusätzliche Informationen:

This article also appears in: Frontiers in Medicinal Chemistry 2022 SPP 1623 - Chemoselective reactions for the synthesis and application of functional proteins

Sachgruppe der Dewey Dezimalklassifikatin (DDC):

500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie

Fachbereich(e)/-gebiet(e):

10 Fachbereich Biologie
10 Fachbereich Biologie > Cell Biology and Epigenetics

Hinterlegungsdatum:

05 Jan 2024 13:56

Letzte Änderung:

08 Jan 2024 07:33

PPN:

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