Hofacker, Annette (2003)
Regulation der Gasvesikelbildung bei Halobacterium salinarum PHH1.
Technische Universität Darmstadt
Dissertation, Erstveröffentlichung
Kurzbeschreibung (Abstract)
Gasvesikel sind intrazelluläre, gasgefüllte Proteinkörperchen, die von H. salinarum PHH1 während des gesamten Wachstums gebildet werden. Die 14 p-gvp-Gene, deren Expression die Bildung der zitronenförmigen Gasvesikel hervorruft, sind auf dem Plasmid pHH1 in der sogenannten p-vac-Region lokalisiert. Innerhalb dieser Region sind die Gene p-gvpACNO, mit p-gvpA für das Hauptstrukturprotein pGvpA, in eine Richtung orientiert, während die Gene p-gvpDEFGHIJKLM genaufwärts von p-gvpA in entgegengesetzter Richtung liegen. Die Notwendigkeit einzelner gvp-Gene für die Gasvesikelbildung konnte in Haloferax volcanii-Transformanten bestimmt werden. Erste Experimente wiesen darauf hin, dass die Gene p-gvpA und p-gvpO essentiell für die Gasvesikelbildung sind, während die Gene p-gvpCN und p-gvpDE nicht benötigt werden. Die Phänotypen von Hf. volcanii-Transformanten, die die p-vac-Region enthielten bei der jeweils ein Gen aus der p-gvpFGHIJKLM-Region deletiert war, zeigten, dass die Gene p-gvpH und p-gvpI für die Bildung der Gasvesikel nicht benötigt werden, während die Gene p-gvpF, p-gvpG, p-gvpJ, p-gvpK, p-gvpL und p-gvpM essentiell sind. Diese Ergebnisse zeigten, dass die acht Gene p-gvpA, p-gvpO, p-gvpFG und p-gvpJKLM der p-vac-Region für die Bildung von Gasvesikeln essentiell sind. Transformanten, die das Konstrukt p-gvpFGJKLM-AO enthielten, bildeten jedoch keine Gasvesikel wegen unzureichender Expression der Gene p-gvpJKLM. Die zusätzliche Überexpression der Gene p-gvpJKLM auf einem zweiten Vektorkonstrukt führte zu Transformanten, die Gasvesikel bildeten, was zeigte, dass die acht Gene p-gvpFGJKLM-AO zur Gasvesikelbildung ausreichen. Die Expression der 14 p-gvp-Gene geht von den Promotoren pA, pD, pF und pO aus, die vor den jeweiligen p-gvp-Genen liegen, zu unterschiedlichen Zeitpunkten des Wachstums aktiv sind und teilweise durch GvpD oder GvpE reguliert werden. Der pA-Promotor ist konstitutiv aktiv. Transkriptionsanalysen und Studien mit Hilfe des bgaH-Reportergens, das für eine halobakterielle b-Galaktosidase kodiert, zeigten, dass die Aktivität des pA-Promotors durch den Transkriptionsaktivator pGvpE erhöht wird. Ein repressorischer Effekt von pGvpD auf den pA-Promotor wurde nur in Kombination mit pGvpE beobachtet. Der pD-Promotor ist nur während der stationären Wachstumsphase aktiv. Transkriptionsanalysen und Untersuchungen mit dem bgaH-Reportergen zeigten, dass der pD-Promotor ebenfalls durch den Transkriptionsaktivator pGvpE aktiviert wird. Der pF-Promotor, der nur während des exponentiellen Wachstums aktiv ist und zur Bildung des p-gvpFGHIJKLM-Transkripts führt, wird weder durch pGvpD noch durch pGvpE reguliert. Ähnliches konnte für den ebenfalls exponentiell aktiven pO-Promotor gezeigt werden, der weder durch pGvpD noch durch pGvpE oder durch andere Genprodukte der p-vac-Region in seiner Aktivität beeinflusst wird.
Typ des Eintrags: |
Dissertation
|
Erschienen: |
2003 |
Autor(en): |
Hofacker, Annette |
Art des Eintrags: |
Erstveröffentlichung |
Titel: |
Regulation der Gasvesikelbildung bei Halobacterium salinarum PHH1 |
Sprache: |
Deutsch |
Referenten: |
Pfeifer, Prof. Dr. Felicitas ; Nixdorff, Prof. Dr. Kathryn |
Berater: |
Pfeifer, Prof. Dr. Felicitas |
Publikationsjahr: |
14 Februar 2003 |
Ort: |
Darmstadt |
Verlag: |
Technische Universität |
Datum der mündlichen Prüfung: |
5 Juli 2002 |
URL / URN: |
urn:nbn:de:tuda-tuprints-2981 |
Kurzbeschreibung (Abstract): |
Gasvesikel sind intrazelluläre, gasgefüllte Proteinkörperchen, die von H. salinarum PHH1 während des gesamten Wachstums gebildet werden. Die 14 p-gvp-Gene, deren Expression die Bildung der zitronenförmigen Gasvesikel hervorruft, sind auf dem Plasmid pHH1 in der sogenannten p-vac-Region lokalisiert. Innerhalb dieser Region sind die Gene p-gvpACNO, mit p-gvpA für das Hauptstrukturprotein pGvpA, in eine Richtung orientiert, während die Gene p-gvpDEFGHIJKLM genaufwärts von p-gvpA in entgegengesetzter Richtung liegen. Die Notwendigkeit einzelner gvp-Gene für die Gasvesikelbildung konnte in Haloferax volcanii-Transformanten bestimmt werden. Erste Experimente wiesen darauf hin, dass die Gene p-gvpA und p-gvpO essentiell für die Gasvesikelbildung sind, während die Gene p-gvpCN und p-gvpDE nicht benötigt werden. Die Phänotypen von Hf. volcanii-Transformanten, die die p-vac-Region enthielten bei der jeweils ein Gen aus der p-gvpFGHIJKLM-Region deletiert war, zeigten, dass die Gene p-gvpH und p-gvpI für die Bildung der Gasvesikel nicht benötigt werden, während die Gene p-gvpF, p-gvpG, p-gvpJ, p-gvpK, p-gvpL und p-gvpM essentiell sind. Diese Ergebnisse zeigten, dass die acht Gene p-gvpA, p-gvpO, p-gvpFG und p-gvpJKLM der p-vac-Region für die Bildung von Gasvesikeln essentiell sind. Transformanten, die das Konstrukt p-gvpFGJKLM-AO enthielten, bildeten jedoch keine Gasvesikel wegen unzureichender Expression der Gene p-gvpJKLM. Die zusätzliche Überexpression der Gene p-gvpJKLM auf einem zweiten Vektorkonstrukt führte zu Transformanten, die Gasvesikel bildeten, was zeigte, dass die acht Gene p-gvpFGJKLM-AO zur Gasvesikelbildung ausreichen. Die Expression der 14 p-gvp-Gene geht von den Promotoren pA, pD, pF und pO aus, die vor den jeweiligen p-gvp-Genen liegen, zu unterschiedlichen Zeitpunkten des Wachstums aktiv sind und teilweise durch GvpD oder GvpE reguliert werden. Der pA-Promotor ist konstitutiv aktiv. Transkriptionsanalysen und Studien mit Hilfe des bgaH-Reportergens, das für eine halobakterielle b-Galaktosidase kodiert, zeigten, dass die Aktivität des pA-Promotors durch den Transkriptionsaktivator pGvpE erhöht wird. Ein repressorischer Effekt von pGvpD auf den pA-Promotor wurde nur in Kombination mit pGvpE beobachtet. Der pD-Promotor ist nur während der stationären Wachstumsphase aktiv. Transkriptionsanalysen und Untersuchungen mit dem bgaH-Reportergen zeigten, dass der pD-Promotor ebenfalls durch den Transkriptionsaktivator pGvpE aktiviert wird. Der pF-Promotor, der nur während des exponentiellen Wachstums aktiv ist und zur Bildung des p-gvpFGHIJKLM-Transkripts führt, wird weder durch pGvpD noch durch pGvpE reguliert. Ähnliches konnte für den ebenfalls exponentiell aktiven pO-Promotor gezeigt werden, der weder durch pGvpD noch durch pGvpE oder durch andere Genprodukte der p-vac-Region in seiner Aktivität beeinflusst wird. |
Alternatives oder übersetztes Abstract: |
Alternatives Abstract | Sprache |
---|
Gas vesicles are intracellular, gas-filled, proteinaceous particles formed by H. salinarum PHH1 to provide buoyancy in the watery environment. The 14 different p-gvp-genes are present in the p-vac-region on plasmid pHH1 and the expression of these genes leads to spindle-shaped gas vesicles throughout growth. These genes are arranged as p-gvpACNO and, upstream of p-gvpA and oriented in the opposite direction p-gvpDEFGHIJKLM. The necessity of single gvp-genes for gas vesicle formation was analyzed in Haloferax volcanii transformants. Initial experiments indicated, that p-gvpA and p-gvpO are necessary for gas vesicle formation whereas p-gvpCN and p-gvpDE are not essential. The gas vesicle negative (Vac-) phenotypes of Hf. volcanii transformants harbouring the p-vac region with a deletion of a single gene in the p-gvpFGHIJKLM cluster indicated, that p-gvpH and p-gvpI are not essential for gas vesicle formation whereas the genes p-gvpF, p-gvpG, p-gvpJ, p-gvpK, p-gvpL and p-gvpM are required. These results implied that the eight genes p-gvpA, p-gvpO, p-gvpFG and p-gvpJKLM constitute the minimal number of genes required for gas vesicle formation. However, a transformant containing the construct p-gvpFGJKLM-AO did not produce gas vesicles due to unsufficient expression of the p-gvpJKLM-genes. Additional copies of the p-gvpJKLM genes resulted in transformants containing gas vesicles, suggesting that the eight genes p-gvpFGJKLM-AO represent indeed the minimal number of genes required for gas vesicle formation. The expression of the p-vac region is driven by the four promoters pA, pD, pF and pO located in front of the respective p-gvp gene. These promoters are active at different phases of growth and in part regulated by GvpD and GvpE. The pA-promoter is constitutively active. Transcript analyses and analyses using the bgaH reporter gene, encoding a halobacterial b-galactosidase, indicated that the pA-promoter is activated by pGvpE, a transcripional activator. A repressor effect of pGvpD was only observed together with GvpE. The pD-promoter is active only in stationary growth phase. Transkript analyses and analyses with the bgaH reporter gene indicated, that the pD-promoter is although activated by the transcripional activator pGvpE. The pF-promoter is only active during exponential growth and leads to the p-gvpFGHIJKLM transcript and neither pGvpE nor GvpD has effect on the pF-promoter activity. Similar results were obtained with the p-gvpO promoter which only active during exponential growth phase and is regluated neither by pGvpD nor by pGvpE or other gene products of the p-vac-region. | Englisch |
|
Freie Schlagworte: |
archaea, halobacteria, p-vac, vac phenotype, promoter, gene regulation |
Sachgruppe der Dewey Dezimalklassifikatin (DDC): |
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie |
Fachbereich(e)/-gebiet(e): |
10 Fachbereich Biologie |
Hinterlegungsdatum: |
17 Okt 2008 09:21 |
Letzte Änderung: |
26 Aug 2018 21:24 |
PPN: |
|
Referenten: |
Pfeifer, Prof. Dr. Felicitas ; Nixdorff, Prof. Dr. Kathryn |
Datum der mündlichen Prüfung / Verteidigung / mdl. Prüfung: |
5 Juli 2002 |
Export: |
|
Suche nach Titel in: |
TUfind oder in Google |
|
Frage zum Eintrag |
Optionen (nur für Redakteure)
|
Redaktionelle Details anzeigen |