Das Griselimycin-Derivat Methylgriselimycin (MGM) zeigt sowohl in vitro als auch in vivo hohe Aktivität gegen M. tuberculosis und ist somit ein vielversprechender Wirkstoffkandidat. Um einen tieferen Einblick in die Struktur-Aktivitäts-Beziehung zu erhalten und die Anwendbarkeit der RDC-Methode von kleinen Molekülen auf kleine und mittlere Peptide zu erforschen, wurde MGM mit NMR-spektroskopischen Mitteln untersucht. Bei der Analyse wurden NOE- und RDC (dipolare Restkopplungen)-restraints verwendet. Für die RDC-Analyse wurden anisotrope Proben in einem chemisch quervernetzten PDMS-Gel in CDCl3 angesetzt. In einer anschließenden simulated-annealing Berechnung mit XPLOR-NIH konnten niederenergetische Strukturen mit den ermittelten restraints berechnet werden. In einem Verfeinerungsprozess konnten zwei Strukturmodelle ermittelt werden, welche alle experimentellen Daten erfüllen.
Mit den gleichen NMR-spektroskopischen Methoden wurde ein Fotoschalter (Dithienylcyclopenten-Derivat) und ein antibiotisches Cyclopentenonderivat (4,6-Diacetylhygrophorone A12) untersucht.
| Typ des Eintrags: |
Dissertation
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| Erschienen: |
2016 |
| Autor(en): |
Fredersdorf, Maic |
| Art des Eintrags: |
Erstveröffentlichung |
| Titel: |
NMR-Spektroskopische Strukturaufklärung eines neuen antituberkulotisch wirksamen Depsipeptids und weiterer kleiner Moleküle |
| Sprache: |
Deutsch |
| Referenten: |
Thiele, Prof. Dr. Christina M. ; Reggelin, Prof. Dr. Michael |
| Publikationsjahr: |
12 Mai 2016 |
| Ort: |
Darmstadt |
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Datum der mündlichen Prüfung: |
25 April 2016 |
| URL / URN: |
http://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/5454 |
| Kurzbeschreibung (Abstract): |
Das Griselimycin-Derivat Methylgriselimycin (MGM) zeigt sowohl in vitro als auch in vivo hohe Aktivität gegen M. tuberculosis und ist somit ein vielversprechender Wirkstoffkandidat. Um einen tieferen Einblick in die Struktur-Aktivitäts-Beziehung zu erhalten und die Anwendbarkeit der RDC-Methode von kleinen Molekülen auf kleine und mittlere Peptide zu erforschen, wurde MGM mit NMR-spektroskopischen Mitteln untersucht. Bei der Analyse wurden NOE- und RDC (dipolare Restkopplungen)-restraints verwendet. Für die RDC-Analyse wurden anisotrope Proben in einem chemisch quervernetzten PDMS-Gel in CDCl3 angesetzt. In einer anschließenden simulated-annealing Berechnung mit XPLOR-NIH konnten niederenergetische Strukturen mit den ermittelten restraints berechnet werden. In einem Verfeinerungsprozess konnten zwei Strukturmodelle ermittelt werden, welche alle experimentellen Daten erfüllen.
Mit den gleichen NMR-spektroskopischen Methoden wurde ein Fotoschalter (Dithienylcyclopenten-Derivat) und ein antibiotisches Cyclopentenonderivat (4,6-Diacetylhygrophorone A12) untersucht. |
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Alternatives oder übersetztes Abstract: |
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Alternatives Abstract | Sprache |
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To get a deeper insight into the structure-activity relationship we used nuclear-Overhauser-effect- (NOE) and residual-dipolar-couplings- (RDC) restraints to determine the conformation of the MGM macrocycle in CDCl3. For the RDC-analysis we prepared anisotropic NMR-samples in a chemically cross-linked PDMS-gel. In a subsequent simulated-annealing calculation with XPLOR-NIH we used both NOE- and RDC-data as restraints. We could identify a structural bundle of low-energy structures which were in good agreement with NOE- and backbone RDC-restraints. After a structure refinement process by additionally using the proline side-chain RDCs we could identify two out of the 20 low-energy structures which are in good agreement with all experimental data.
Same kind of NMR-measurement techniques were used to investigates a photoswitchable Dithienylcyclopentene derivative and the antibiotic cyclopentenone 4,6-Diacetylhygrophorone A12. | Englisch |
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| Freie Schlagworte: |
Griselimycin, Methylgriselimycin, Tuberkulose, Diarylethene, Dithienylcyclopentene, Fotoschalter, Hygrophorone, antibiotisch, NMR-Spektroskopie, dipolare Restkopplungen, RDC, Alignment Medien, XPLOR-NIH, Maestro Schrödinger |
| Schlagworte: |
| Einzelne Schlagworte | Sprache |
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| Griselimycin, Methylgriselimycin, tuberculosis, Diarylethene, Dithienylcyclopentenes, photoswitches, Hygrophorone, antibiotic, NMR-Spektroscopy, residual dipolar couplings, RDC, alignment media, XPLOR-NIH, Maestro Schrödinger | Englisch |
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| URN: |
urn:nbn:de:tuda-tuprints-54540 |
| Sachgruppe der Dewey Dezimalklassifikatin (DDC): |
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie |
| Fachbereich(e)/-gebiet(e): |
07 Fachbereich Chemie > Clemens-Schöpf-Institut > Fachgebiet Organische Chemie
07 Fachbereich Chemie |
| Hinterlegungsdatum: |
15 Mai 2016 19:55 |
| Letzte Änderung: |
15 Mai 2016 19:55 |
| PPN: |
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| Referenten: |
Thiele, Prof. Dr. Christina M. ; Reggelin, Prof. Dr. Michael |
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Datum der mündlichen Prüfung / Verteidigung / mdl. Prüfung: |
25 April 2016 |
| Schlagworte: |
| Einzelne Schlagworte | Sprache |
|---|
| Griselimycin, Methylgriselimycin, tuberculosis, Diarylethene, Dithienylcyclopentenes, photoswitches, Hygrophorone, antibiotic, NMR-Spektroscopy, residual dipolar couplings, RDC, alignment media, XPLOR-NIH, Maestro Schrödinger | Englisch |
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